Der Hydrographische Dienst hat rund um den Neusiedler See acht Messstellen für den Wasserstand eingerichtet, die von jedermann betrachtet werden können:

• Mörbisch (rote Mess-Latte)
• Rust (rote Mess-Latte + Anzeige-Display)
• Breitenbrunn (2 rote Mess-Latten)
• Neusiedl (rote Mess-Latte + Anzeige-Display)
• Podersdorf (rote Mess-Latte)
• Illmitz/Biologische Station (rote Mess-Latte)
• A 79 (rote Mess-Latte)

Alle diese Pegel sind auf den Nullpunkt von 114,00 Metern über der Adria (müA) geeicht.

Seit 1965 wird der Wasserstand an der Wehranlage Mekszikópuszta nach fixen Vorschriften beeinflusst. Deren Festlegung erfolgt durch die bilaterale Gewässerkommission.

Bis 2010 galt folgende Regelung:

Die Schleuse wurde bis 2010 zu folgenden Zeiten und bei Überschreitung folgender Wasserstände geöffnet:

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Geschlossen wurde die Wehranlage dann, wenn der selbe Wert unterschritten wird. Nach oben hin wurden je nach Witterung Abweichungen bis zu 5 cm toleriert, bevor die Schleuse geöffnet wird.

Vor 1996 lagen die Öffnungswerte der Schleuse um ca. 25 cm niedriger und es wurden Durchschnittswerte der vergangenen drei Jahre für die Berechnung einbezogen. Damals vermutete man einen stärkeren Einfluss des Grundwasserspiegels auf den Seewasserstand. Untersuchungen bestätigten aber, dass 29 unterschiedliche Grundwassersektionen im Seewinkel existieren, die sich mit dem See nicht wie kommunizierende Gefäßeverhalten (das hieße, dass überall der gleiche Wasserdruck herrschte). In diesem Fall könnte der Wasserstand auch langfristig prognostiziert werden. Aufgrund der neuen Erkenntnisse wurden die alten Regelungen verworfen und neue Grenzwerte festgelegt.

Erfolgt nun die Öffnung der Wehranlage, so beginnt die Ablassung nicht mit voller Kapazität. Erst nach einiger Zeit liegt im Bedarfsfall Volllast an.

Die Schleusenkapazität liegt maximal bei 15 m³ pro Sekundebzw. bei 1,3 Mio m³ pro Tag. Um in einer Hochwasser-Situation 10 cm Wasser abzulassen, muss die Schleuse bis zu 25 (!) Tage voll geöffnet sein. Die Wassermenge, die einem Zentimeter des Neusiedler Sees ausmacht, beträgt etwa 3 Mio m³. Dies entspricht der gesamten Österreichischen Weinproduktion eines Jahres.

Während der Sommermonate wird die maximale Kapazitätder Schleuse nicht erreicht, da in Ungarn die Ableitungen der Bewässerungsanlagen für landwirtschaftliche Nutzflächen ebenfalls in den Hanságkanal geleitet werden. Würde die Schleuse vollständig geöffnet, könnten die Abwässer nicht abrinnen sondern würden auf die Felder rückgestaut werden. Das Wasser des Neusiedler Sees wird also nicht zur Bewässerung ungarischer Felder benutzt. Die einzige Wasserentnahme dient zur Auffüllung kleiner Wasserbecken eines Bio-Reservats im Naturschutzgebiet. Diese Entnahmen sind mit weniger als 4 mm pro Jahr vernachlässigbar.

Aufgrund der beschränkten Entnahmekapazität an der Schleuse können extreme Anstiege des Wasserstandes kurzfristig nicht ausgeglichen werden.

Da die Oberkante der Wehranlage auf etwa 116,50 müAliegt, kann auch bei starken Windverfrachtungen kein Wasser über das Wehr hinwegfließen, wenn dieses geschlossen ist.

Der Hydrographische Dienst in Eisenstadt ist per Fernüberwachung stets über die aktuellen Bedingungen an der Wehranlage informiert. Zusätzlich erfolgen wöchentliche Kontrollfahrten.

Das trotz geschlossener Wehranlage im Hanságkanal stehende Wasser stammt von anderen Zubringern und vom Grundwasser.

Warum auf eine Schleusenregelung nicht gänzlich vezichtet werden kann und der Kanal so ständig geschlossen bliebe, liegt an den unterschiedlichsten Interessensgruppen. Während Wassersportler und Fischer starke Pegelanstiege begrüßen, entstehen an landwirtschaftlichen Nutzflächen massive Schäden. Auch das Kanalsystem der Seegemeinden wäre betroffen. Da der Bund in diesem Fall schadenersatzpflichtig wird, müssen extreme Wasseranstiege hintangehalten werden.

Diese Regelungen liefen 2010 aus und wurden durch etwas genauere, aber wesentlich kompliziertere  ersetzt..Ziel der neuen Wehrbetriebsordnung ist es einerseitsextremes Hochwasser zu vermeiden (ein Seewasserstand von 116,00 m ü. A. wurde als ein 100-jährliches Ereignis definiert), andererseits den mittleren Wasserstand zu erhöhen, weil

ein höherer mittlerer Wasserpegel

• hat positive Auswirkung auf die Wasserqualität
• begünstigt die Wassersportnutzung
• begünstigt den Wasseraustausch mit dem Schilfgürtel
• gut für die Fischerei
• wirkt tendenziell der weiteren Ausbreitung des Schilfgürtels entgegen

Link zur aktuellen Wasserstandregelung

Links zum Wehr:

• Pegelstände am Wehr:http://www.edukovizig.hu/ferto_to
  Es lassen sich die Pegelstände "felviz" (ober Wehr) und "alviz" (unter Wehr) sowie die Höhe der Wehrtafeln-Oberkanten ablesen. Bei den „Tafelwerten“ handelt es sich um die Oberkante der beiden Wehrtafeln. Ober- und Unterwasser haben einen Pegelnullpunkt von 114,00 müA.
• Verlauf der Pegelstände:http://www.edukovizig.hu/napivizallas
  Hier lassen sich das Öffnen und Schließen des Wehrs gut ablesen. Wenn das Wehr geschlossen ist, fällt der Wasserstand unter dem Wehr rasch ab. Wird das Wehr geöffnet, steigt er wieder an.

Seit den 30er-Jahren des zwanzigsten Jahrhunderts existieren Überlegungen, wie dem See Wasser aus externen Quellen zugeführt werden könnte. Damals scheiterten Pläne einer Wasserentnahme aus der Leitha.

In den 80er-Jahren, mit dem geplanten Baubeginn des Donau-Kraftwerks Hainburg entstanden Pläne, das Donauwasserzuzuleiten. Durch das Staubecken hätte ein freies Gefälle bis zum Neusiedler See bestanden. Da das Kraftwerk letztlich nicht gebaut wurde, waren die Pläne vom Tisch. Ein Zuleitung von der Staustufe Freudenau (durch Wien) kam aufgrund der großen Entfernung nie in Frage.

In früheren Jahren flutete Donauhochwasser über die Raab bis in den Neusiedler See. Seit in Györ das Hochwassertorerrichtet wurde, ist die Raab aber vor Hochwasser gesichert.

Seit 2002 wurde wieder einmal über eine Zuleitung nachgedacht. Im Mittelpunkt der Überlegungen stand bis ca. 2002 das Raab-Rabnitz-System. Das Wasser müsste zwar angehoben werden, dies wäre aber technisch möglich. Möglicherweise könnten damit 10-15 cm Wasser pro Jahr zugeführt werden. Auch über eine Zuleitung von der Donau wird diskutiert.

Die größten Stolpersteine sind die Überlegungen betreffend der Verträglichkeit dieses Fremdwassers sowie politische Überlegungen. Nur wenn die Zuleitung ökologisch vertretbar ist, die Finanzierung möglich ist und die alle politischen Interessen vereinbar sind. kann über eine Verwirklichung nachgedacht werden. Derzeit werden mehrere Varianten geprüft. Realisierungszeitraum ca. 2012.

Mit der Initiative Wasserstand Neusiedler See wurde 1995 eine Forum der Befürworter einer Wasserzuleitung ins Leben gerufen. Die Überlegungen zur Zuleitung und die Initiative Wassersport verschwinden mit der Zunahme des Wasserstandes in den Jahren 2004 - 2009 wieder in den politischen Schubladen.

Ab 2017 sinkt der Wasserstand wieder dramatisch im Herbst auf 115,35 Meter. Erneute Pläne für eine Dotierung des Seewassers durch einen Zufluß werden geschmiedet. Die Initiative geht diesmal von Ungarn aus. Die ungarische Regierung plant ein großes Tourismusprojekt mit neuem Strandbad, Hotel und einer Marina für 800 Schiffe in Fertörakos. 

Bei diesem Projekt soll ein bestehender Bewässerungskanal in Ungarn verlängert werden, um Wasser aus dem Altarm der Moson-Donau in den Seewinkel zu leiten, erklärt Landesrat Heinrich Dorner (SPÖ) das künftige Bewässerungsprojekt für den Seewinkel. Diese zusätzliche Wasserzuführung sei ökologisch vernünftig und ökonomisch vertretbar, so Dorner: „Wir beteiligen uns am Bau dieses Kanals mit drei Millionen Euro und sichern uns damit für die zukünftigen Schritte eine Mögliche Übernahme des Wassers aus der Moson-Donau. Das Ziel ist klar: Das Wasser soll so lange wie möglich in der Region erhalten werden um die derzeitige hydrologische Situation zu verbessern.“ Allerdings soll eine direkte Dotierung des Sees laut Dorner erst ab einem Wasserstand von 115,0 Meter erfolgen. Ein Wasserstand der für die Ausübung des Segelsports in weiten bereichen des Sees nicht ausreichend ist (Wasserstand im September 2021 115,19)

Im September 2019 erreicht der See mit 115,19 Meter den tiefsten Wasserstand seit 2003 (115,10)  . Trotz eines besseren Wasserstandes im Frühjahr sinkt der Wasserspiegel im Sommer 2021 wieder auf den Wert von 2019 ab und liegt im September 2021 wieder auf dem negativen Rekordwert des Vorjahres.

Hinzu kommt eine zunehmende Verschlammung des Westufers des Neusiedlersees, die den Zugang zum See in Rust und Breitenbrunn erschwert. Bei einem Wasserstand von 115,0 wäre eine Ausübung des Segelsports in diesen Seebereichen nur mehr sehr eingeschränkt mit Jollen und kleinen Jollenkreuzer möglich. 

Lokale initiativen den Schlamm zu beseitigen sind in Rust derzeit nicht geplant. Man hofft auf die vom Land koordinierten Maßnahmen. Dazu wurde eine eigene Seemanagement GmbH gegründet, die für gesamtheitliche Lösungen sorgen soll.

Kurzfristig bleibt uns nur die Hoffnung auf einen natürlichen Zufluß von oben wie in der Saison 1964/65. Damals stieg der Wasserstand innerhalb 6 Monate um 77 cm auf 115,62.